学校始建于1960年，名称为内蒙古财经现金三公。1962年改建为内蒙古财贸干部进修现金三公，1965年改为内蒙古财贸学校。1979年恢复本科招生，1980年经国务院批准复建内蒙古财经现金三公。2000年现金三公与内蒙古经济管理干部现金三公合并成立新的内蒙古财经现金三公。2005年取得硕士学位授予权。2006年内蒙古财税职业现金三公、内蒙古工商行政管理学校并入现金三公。2012年经现金三公批准，现金三公更名为内蒙古财经大学。学校是一所以本科和研究生教育为主、同时承担高等职业教育、继续教育培养任务，以经济学、管理学为主，理学、法学、文学、工学协调发展，具有鲜明地区和民族特色的多科性财经大学。
