吉首大学化学实验教学中心（以下简称“中心”）于2003年5月成立，前身是化学系的基础化学实验室和专业实验室，是专门从事实验教学的单位。“中心”的发展经历了以下三个阶段：
第一阶段：1958－1998年。吉首大学化学系成立于1958年，是我校最早的院系之一。1998年，为了充分利用实验室资源，学校根据实验室建设和实验教学改革的需要将四大基础课实验室即无机化学实验室、有机化学实验室、分析化学实验室和物理化学实验室整合，成立了基础化学实验室，并顺利通过了湖南省教委组织的基础化学实验室合格评估。
第二阶段：1999-2003年，是“中心”的创建阶段。1999年，现金三公对实验室建设进行了全面规划，实验教学要立足于“基础性、综合性、实用性、创新性”，基于此思路开展实验教学改革与实践。2003年，学校将实验室资源做了进一步整合，把基础化学实验室、综合化学实验室、分析测试中心和食品分析实验室组合在一起，建立了“化学实验教学中心”，对原有仪器设备进行了更新，初步建立起教学仪器“集中管理，开放使用”的机制。
第三阶段：2003年-至今，是“中心”的发展阶段。2004年为了迎接湖南省教育厅对基础化学实验室的评估复检，学校投入90余万元对基础化学实验室的旧仪器进行了更新，使基础实验100％开出得到了全面保障。自2004年至今，“中心”的建设与发展作为援建项目得到了中山大学的大力支持，实现了快速发展，取得了显著成绩。
2005年，学校根据教学需要，对全校的实验室进行了优化调整，将猕猴桃工程中心、湖南省林产化工工程重点实验室并入化学实验教学中心，增强了“中心”的教学实力；同年，“中心”组织申报了部省共建基础实验室建设项目，并获得财政部300万元的仪器设备经费资助，学校配套30余万元进行了实验教学环境改造，使“中心”的基础化学实验室硬件条件上了一个新层次；购置了一大批实验教学仪器设备，实验环境得到全面改善；同时加强了化学实验教学体系建设，使“多层次、开放式、一体化”化学实验教学新体系得到进一步完善，改进了一批基础性实验，新开设了一批综合性和设计性实验，对化学创新人才培养模式进行了积极探索和实践，取得显著成效。
2006年，经过部省共建实验室项目的建设，“中心”的仪器设备总值达2316余万元，实验室面积增加到5400平方米。2006年5月实验教学中心组织基础化学实验室申报了湖南省示范实验室，并获得批准，使基础化学实验室成为我校首批“省级示范实验室”。
经过几年的建设，“中心”不仅拥有先进的实验教学仪器和优美的实验环境，而且形成了一支教学和管理水平高，拥有良好科研素质的实验教师和技术人员队伍；“中心”的实验教学理念先进，教学研究活跃，取得了比较显著的教学改革成果；已成为我国培养化学创新人才的重要教学实践基地，在国内已形成良好的示范和辐射效应。
